根尖周病若未及時治療，膿液可能穿破骨組織導致多部位併發症。以下是常見情況：
上顎牙齿並發症
- 上顎中切牙：牙槽突低而牙根長時，膿液易穿通鼻腔底。
- 上顎側切牙：根尖常偏向舌側，膿液可穿破齦側骨板形成膿腫。
- 上顎後牙：牙根與上顎 sinus 底部接近，膿液可能穿入上顎 sinu。
- 上顎磨牙：齒根膿腫可自骨膜下向後擴展至軟顏。
下顎牙齿並發症
- 下顎切牙：可能引發顏部腫脹。
- 下顎磨牙：當牙根較長時，膿液在頷舌骨肌附著處向下口底組織擴散，嚴重時可導致：
- 嚴重口底蜂窩組織炎
- 顎骨骨髓炎
- 偶見海綿窦血栓（極嚴重併發症）